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从交易结构的角度，单一资金信托和集合资金信托并没有本质上的区别。
第一，从交易主体上，两者没有本质区别。
第二，从资金运用方式上，单一资金信托的资金运用方式更为单一，贷款运用型所占比例更高，投资和交易性的比例更小，主要原因是单一资金信托的委托人多数对资金运用对象有相当充分的了解，希望借助单一资金信托的通道借款给资金使用者。如果是投资运用资金，机构多数会选择自己直接通过股权投资方式进行，一般不会借助信托公司的渠道。
两者交易结构上的主要区别，集合资金信托产品经常借助于受益权分层分级，将受益权分为劣后、优先等层级，以增强信用等级，保障社会投资者的权益，尤其是在股权投资类、证券投资类产品中更是如此。单一资金信托比集合资金信托产品更加单纯、简洁。另外，单一信托资金几乎都是运用于一个对象、一个项目。
