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1、总分公司的话,总公司是独立的法人,也是一个会计主体,但分公司不是独立的法人,但能作为一个独立的会计核算机构。2、分公司的账务要归结到总公司的,这是肯定的。(可能和母子公司有些类似,就是你分公司自己可以建账套,但最终所有的资产负债收入利润等要并入总公司账上)3、税务上只承认总公司的,就是说你分公司不能单独作为法人机构申报,要通过归结到总公司申报。(母子公司的话母公司子公司因为都是法人都是独立核算机构所以可以各自申报,只不过也需要编制合并财务报表)4、根据我的看法是要开票的。5、这就不清楚了。应该要有相应的文件什么的,不一定是开票。具体建议去咨询当地税务局,他们会知道。这种事还是弄清楚为好,不然以后会很麻烦的。