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（1）申请购买手续不同。购买纸质凭证式国债，投资者可直接填写申请办理；购买电子记账凭证式国债，投资者需开立债券账户和资金账户，并填写购买申请后办理。
（2）债权记录方式不同。纸质凭证式国债采取填制“中华人民共和国凭证式国债收款凭证”的形式记录，由各承销团成员分支机构进行管理；电子记账凭证式国债债权采取二级托管体制，由各承办银行总行和中央国债登记结算有限责任公司以电子记录管理。
（3）到期兑付方式不同。在国债利息计付方面，纸质凭证式国债到期后，需投资者前往承销机构网点办理兑付事宜，逾期不加计利息。而电子记账凭证式国债到期后，用户可通过网银中的“国债兑付”完成兑付事宜，逾期不加计利息。这种灵活的计息方式，增强了国债作为投资品种的竞争力。
